какой аксель ? батарейка норм ? если близ то нарушение контактов (при перепайке) исключено... при вставленной другой батарейке питание на ней сколько вольт (при неподключенном акселе к амиге и при подключенном сколько) ?
ps только потом можно сделать выводы о рабочести кварца,рабочести rtc и ее обвязки (микросхемы) и цепей заряда самой батарейки